逻辑复制目前有以下限制或缺失的功能。这些问题可能会在未来的版本中解决。
数据库模式和DDL命令不会被复制。初始模式可使用pg_dump --schema-only手动复制。后续的模式变更需要手动保持同步。（注意，两端的模式不需要完全相同。）当数据库模式在运行中发生变更时，逻辑复制是健壮的：当发布端模式变更后，复制的数据开始到达订阅端但不符合表的模式时，复制会出错，直到模式被更新。在很多情况下，通过先在订阅端应用增量式模式变更，可以避免间歇性错误。
序列数据不会被复制。由序列支撑的serial或标识列中的数据当然会作为表的一部分被复制，但序列本身在订阅端仍然显示起始值。如果把订阅端用作只读数据库，通常不会有问题。但如果打算切换或故障切换到订阅端数据库，则需要把序列更新到最新值，可以通过从发布端复制当前数据（例如使用pg_dump），或者从表本身确定一个足够大的值。
支持TRUNCATE命令的复制，但在截断由外键连接的表组时需要注意。当复制truncate操作时，订阅端将截断与发布端截断的同一组表（显式指定的或通过CASCADE隐式收集的），但不包括不属于该订阅的表。如果所有受影响的表都属于同一个订阅，这将正确工作。但如果订阅端要被截断的某些表对不属于同一（或任何）订阅的表有外键链接，那么在订阅端应用truncate操作将失败。
大对象（见Chapter 34）不会被复制。除了将数据存储在普通表中之外，没有其他解决方案。
只能从基表复制到基表。也就是说，发布端和订阅端的表必须都是普通表，不能是视图、物化视图、分区根表或外部表。因此，对于分区，可以一对一复制分区层次结构，但目前还不能复制到采用不同分区方式的目标。尝试复制基表以外的表会导致错误。